V polovině září 2024 zasáhla Nivnici povodeň, která po třídenních extrémních deštích překročila třetí stupeň povodňové aktivity a podle Povodí Moravy dosáhla téměř úrovně stoleté vody. Voda zaplavila ulice, rodinné domy i sportovní areál a způsobila rozsáhlé škody na vodohospodářských objektech a samotném korytě Nivničky.
Povodí Moravy zahájilo v srpnu 2025 opravu poškozeného úseku dlouhého 800 metrů. „Opraveny byly přelivné hrany a opevnění dna dvou spádových stupňů a také břehové opevnění toku v místě vzniku nátrží tak, aby zvětšováním nátrží nebyla ohrožena místní komunikace,“ uvedla JanaKučerová, mluvčí Povodí Moravy. Dodala, že kapacitní parametry objektů i koryta zůstaly zachovány.
Práce státní podnik dokončil v listopadu 2025 a náklady dosáhly 2,6 milionu korun. Opravy běží také v sousední Suché Lozi, kde povodeň poškodila původní opevnění koryta a snížila jeho kapacitu kvůli velkému množství sedimentu.
